Selected Cell
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Carbon assimilation and partitioning, measured using 14CO2 | |||||||||
Genotypes Col, prr7prr9; Ws, lhycca1 | |||||||||
Labelling in darkness to test C fixation by PEPC without photosynthesis | |||||||||
Labelling protocol | From 'Methods' - PEPC activity and incorporation of labelled 14CO2 into metabolite pools was measured as previously described for whole-plant labelling (Kölling et al. 2013, Kölling et al. 2015) with minor modifications. Near the end of the night (ZT20-21), 28-day-old plants were transferred to a custom built, sealed chamber in the dark. Each replicate consisted of the aerial parts of a single plant. Labelling was initiated through the release of 14CO2 (150 μCi) from NaH14CO3 with the addition of lactic acid. After 1 h, the plants were harvested into 5 ml 80% (v/v) ethanol and incubated for 15 min at 80°C. Following homogenisation, the soluble fraction was collected by centrifugation (2,400g, 12 min), pooled with four sequential 1-ml washes (50% ethanol, 20% ethanol, water, and then 80% ethanol) of the insoluble fraction pellet. The soluble fraction was concentrated under vacuum. A water-soluble sub-fraction was collected by dissolving the near-dry exsiccate in 2 ml water, while the remainder was dissolved in 2 ml 98% ethanol. Basic, acidic, and neutral fractions were separated from the water-soluble fraction by ion-exchange chromatography as described (Quick et al. 1989). Partitioning into protein was measured as described (Kölling et al. 2013). Isotope incorporation into each fraction was measured by liquid scintillation counting. | ||||||||
Sheets in this workbook | Contents | ||||||||
Final Data | mean data, SD and charts | ||||||||
Labelling | Summary of experiment, replicates and timing (ZT) | ||||||||
Harvest Mass | Data on mass of harvested tissue, per replicate | ||||||||
18 days | Partitioning of 14C label in plants at 18 days - use these data for comparison of lhycca1 to its parent Ws | ||||||||
28 days | Partitioning of 14C label in plants at 28 days - note the lhycca1 genotype had started flowering at this timepoint | ||||||||
Credits | |||||||||
Experimental design and analysis | Gavin George, Sam Zeeman group at ETH Zurich | ||||||||
Curation | Andrew Millar | ||||||||
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18 Days | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EtOH | Water | Neutral | Acid | Basic | Insol | Starch | Protein | Cell wall | Assimilation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 | 0.44783639721781787 | ± | 0.04543542414093131 | 86.59258816279475 | ± | 0.8032073167483322 | 0.08771570416643622 | ± | 0.07048602777232704 | 40.52926432957474 | ± | 2.5262081546687742 | 43.74125700701987 | ± | 3.5226742845625796 | 12.959575439987427 | ± | 0.8369099758029841 | 0.9177178972887473 | ± | 0.7978715645510204 | 8.785055784169613 | ± | 0.7612789559370693 | 3.256801758529068 | ± | 0.4211181412095605 | 377.7537984343283 | ± | 26.55853220216979 | ||||||||||||||
prr7/9 | 0.7886351792247885 | ± | 0.4024416923388231 | 82.5043008714346 | ± | 0.8754554070053538 | * | 0.19421013151321795 | ± | 0.13739603188905347 | 44.00025207583705 | ± | 0.5584576389951075 | 34.65610012126357 | ± | 1.4587549861856766 | * | 16.707063949340608 | ± | 1.2604142979692203 | * | 0.03431775909206191 | ± | 0.1617962073106456 | 13.719813498010012 | ± | 1.0717337605792359 | * | 2.9529326922385333 | ± | 0.42253706955437775 | 275.6563134032681 | ± | 41.8160822643151 | * | |||||||||
WS | 0.44192273868188675 | ± | 0.03291544537103846 | 85.87199341501356 | ± | 1.9861423039490287 | -0.046192116560937246 | ± | 0.10293146401224013 | 42.88782457399689 | ± | 2.168316353512296 | 43.97476653684007 | ± | 2.5660556692661527 | 13.686083846304543 | ± | 1.9692421763823178 | 0.19874923253356436 | ± | 0.14054262912707596 | 10.648929627760829 | ± | 1.2610417692161926 | 2.8384049860101506 | ± | 0.7250489634103734 | 385.2983552173646 | ± | 11.11947099385128 | ||||||||||||||
lhy/cca1 | 0.38839844244417515 | ± | 0.011305696234666993 | 87.66875134320924 | ± | 0.6616859381627912 | 0.03501709356264063 | ± | 0.242174820606473 | 40.89549360576745 | ± | 1.9435358548963813 | 44.33442846772069 | ± | 3.3974269961757013 | 11.9428502143466 | ± | 0.672672873341385 | 0.36242565386416775 | ± | 0.1765679870409028 | 9.58158791724833 | ± | 0.3098373581141258 | 1.9988366432341014 | ± | 0.602751078749119 | 634.1374553492403 | ± | 43.20750489431593 | * | |||||||||||||
28 Days | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EtOH | Water | Neutral | Acid | Basic | Insol | Starch | Protein | Cell wall | Assimilation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 | 0.5880259875091256 | ± | 0.6459486258134546 | 84.42303230327809 | ± | 0.9454792960122854 | -0.011283180088240322 | ± | 0.04600689857442257 | 35.31368052143015 | ± | 1.2292815130884744 | 52.56335314113098 | ± | 1.7231085974105698 | 14.988941709212778 | ± | 1.534435552054548 | 2.3975149934639166 | ± | 1.1625119763112792 | 6.961297655899314 | ± | 1.2587212175737352 | 5.6301290598495495 | ± | 0.623644796595388 | 236.18149035759 | ± | 44.99250796500788 | ||||||||||||||
prr7/9 | 0.3899983303242155 | ± | 0.04070830504918652 | 80.2234016014161 | ± | 0.931996207270137 | * | -0.049914728317449544 | ± | 0.043263813419269194 | 42.36684284922242 | ± | 0.49936209900898565 | * | 39.84839696862185 | ± | 1.5357704875892044 | * | 19.386600068259693 | ± | 0.9175596921584043 | * | 1.76407086626919 | ± | 0.7713042077211923 | 11.4853564462326 | ± | 0.5844917804360515 | 6.137172755757903 | ± | 1.2115580541968216 | 251.1481780493945 | ± | 9.341755122604958 | ||||||||||
WS | 0.2536554662649522 | ± | 0.05355653265583025 | 79.21534714686528 | ± | 0.6420048242744627 | 0.03445720354619943 | ± | 0.006916216453753687 | 27.845114794391446 | ± | 0.6582689932241103 | 55.287673698952375 | ± | 0.5755836605401101 | 20.530997386869757 | ± | 0.6388519927509423 | 2.7089373257498015 | ± | 0.46141917231777185 | 10.09663130794166 | ± | 0.8587341525976818 | 7.725428753178295 | ± | 0.6580109495003585 | 187.0311434726941 | ± | 8.504953696810352 | ||||||||||||||
lhy/cca1 (fl) | 0.37449445032369405 | ± | 0.0476570285585143 | * | 90.39347475944122 | ± | 0.7999185055915877 | * | -0.0644640485532166 | ± | 0.08221556939998122 | 42.27574574274346 | ± | 1.5321959297539127 | * | 55.66874642094534 | ± | 1.345439531202377 | 9.232030790235092 | ± | 0.8463401810763305 | * | 0.9244950273178872 | ± | 0.1393066545719478 | * | 5.30059632860077 | ± | 0.5442363496880182 | * | 3.006939434316434 | ± | 0.6140001306069902 | * | 259.6764283147239 | ± | 19.6934717521723 | * | ||||||
Col | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7prr9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EtOH soluble | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Water soluble | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Water insoluble | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Neutral | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Acidic | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Starch | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Experiment number 106a | 16.03.15 | ||||||||
DAP | plants labelled | Pools | Plants per pool | n | |||||
Col-0 | 18 | 12 | 3 | 4 | 3 | ||||
WS | 18 | 12 | 3 | 4 | 3 | ||||
lhy/cca1 | 18 | 12 | 3 | 4 | 3 | ||||
prr7/9 | 18 | 12 | 3 | 4 | 3 | ||||
Time | ZT | ||||||||
Pulse start | 1899-12-31T4:15:0+0000 | "19:15" | |||||||
Pulse end | 1899-12-31T5:15:0+0000 | "20:15" | |||||||
Label | 600 ul | 150 uC | |||||||
EtOH volume | 3 ml | ||||||||
Experiment number 106a | 16.03.15 | ||||||||
DAP | plants labelled | Pools | Plants per pool | n | |||||
Col-0 | 28 | 4 | 4 | 1 | 4 | ||||
WS | 28 | 4 | 4 | 1 | 4 | ||||
lhy/cca1 | 28 | 4 | 4 | 1 | 4 | ||||
prr7/9 | 28 | 4 | 4 | 1 | 4 | ||||
Time | ZT | ||||||||
Pulse start | 1899-12-31T5:50:0+0000 | 1899-12-31T20:50:0+0000 | |||||||
Pulse end | 1899-12-31T6:50:0+0000 | 1899-12-31T21:50:0+0000 | |||||||
Label | 600 ul | 150 uC | |||||||
EtOH volume | 5 ml |
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Experiment 106a | |||||||||
DAP | Genotype | Sample number | Mass (g) | Mass (mg) | Notes | ||||
Experiment 106a | |||||||||
18 | Col-0 | 1 | 0.067 | 67 | Harvested Col-0 and prr7/9 first alternating between | ||||
18 | Col-0 | 2 | 0.043 | 43 | |||||
18 | Col-0 | 3 | 0.0757 | 75.7 | |||||
18 | WS | 1 | 0.0334 | 33.4 | Then WS and lhy so effective 10 min chase | ||||
18 | WS | 2 | 0.0266 | 26.599999999999998 | |||||
18 | WS | 3 | 0.0297 | 29.7 | |||||
18 | lhy/cca1 | 1 | 0.0351 | 35.1 | |||||
18 | lhy/cca1 | 2 | 0.0249 | 24.9 | |||||
18 | lhy/cca1 | 3 | 0.0293 | 29.3 | |||||
18 | prr7/9 | 1 | 0.0366 | 36.6 | |||||
18 | prr7/9 | 2 | 0.0274 | 27.400000000000002 | |||||
18 | prr7/9 | 3 | 0.0244 | 24.400000000000002 | |||||
Experiment 106b | |||||||||
28 | Col-0 | 1 | 0.3097 | 309.7 | This harvest was much faster due to less plants | ||||
28 | Col-0 | 2 | 0.3156 | 315.59999999999997 | Col-0 prr first again then WS lhy | ||||
28 | Col-0 | 3 | 0.2043 | 204.3 | |||||
28 | Col-0 | 4 | 0.2577 | 257.7 | |||||
28 | WS | 1 | 0.2673 | 267.29999999999995 | |||||
28 | WS | 2 | 0.4418 | 441.8 | |||||
28 | WS | 3 | 0.252 | 252 | |||||
28 | WS | 4 | 0.275 | 275 | lost some sample during grinding… will probably have to eliminate from calculations | ||||
28 | lhy/cca1 | 1 | 0.0965 | 96.5 | |||||
28 | lhy/cca1 | 2 | 0.1125 | 112.5 | |||||
28 | lhy/cca1 | 3 | 0.0864 | 86.4 | |||||
28 | lhy/cca1 | 4 | 0.0912 | 91.2 | |||||
28 | prr7/9 | 1 | 0.14 | 140 | |||||
28 | prr7/9 | 2 | 0.1475 | 147.5 | |||||
28 | prr7/9 | 3 | 0.1356 | 135.6 | |||||
28 | prr7/9 | 4 | 0.1603 | 160.3 |
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200
Col-0 3 | Acidic | 527.68 | 10372.8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 1 | Acidic | 292.61 | 5671.4 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 2 | Acidic | 208.59 | 3991 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 3 | Acidic | 270.7 | 5233.199999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 1 | Acidic | 451.35 | 8846.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 2 | Acidic | 359.83 | 7015.799999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 3 | Acidic | 365.04 | 7120 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 1 | Acidic | 185.34 | 3526 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 2 | Acidic | 206.84 | 3956 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 3 | Acidic | 159.95 | 3018.2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Fill in all rawdata into one table! | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Scintillation counting data | Experiment name | Date | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lsc | calculation | total counts | Water sol. Dowex | Insoluble digests | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
no. | sp. | probe name | fraction | solubilized in | dpm | calc dpm | sample | total counts | Assimilation | EtOH | Water | Neutral | Acid | Basic | recovery water sol % | Insol | Starch | Protein | remaining | total counts | % | WT | Satndard deviations | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
all blanks | name | sum of sol, insol, EtOH sol of leaf and rosette | leaf | sum of sol, insol, EtOH sol of leaf | EtOH | Water | Neutral | Acid | Basic | Insol | Starch | Protein | Remaining | EtOH | Water | Neutral | Acid | Basic | Insol | Starch | Protein | Cell wall | Assimilation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
sol blank | 10.72 | A.t. | Col-0 1 | 52870.28 | 170.7144979011947 | 137.64000000000001 | 44728.64 | 8.79999999999999 | 17781.600000000002 | 28506.199999999997 | 103.50549446618543 | 8004 | 820 | 4712.549999999999 | 2471.4500000000007 | sum of sol, insol, EtOH sol of rosette | Col-0 1 | 0.2603352961247794 | 84.60072464151884 | 0.016644511812685673 | 33.63250582368772 | 53.91724802667963 | 15.138940062356394 | 1.5509658734548029 | 8.91341978896272 | 4.67455439993887 | Col-0 | 0.5880259875091256 | ± | 0.6459486258134546 | 84.42303230327809 | ± | 0.9454792960122854 | -0.011283180088240322 | ± | 0.04600689857442257 | 35.31368052143015 | ± | 1.2292815130884744 | 52.56335314113098 | ± | 1.7231085974105698 | 14.988941709212778 | ± | 1.534435552054548 | 2.3975149934639166 | ± | 1.1625119763112792 | 6.961297655899314 | ± | 1.2587212175737352 | 5.6301290598495495 | ± | 0.623644796595388 | 236.18149035759 | ± | 44.99250796500788 | EtOH | Water | Neutral | Acid | Base | Insol | Assimilation | |||||||||||||||
EtOH blank | 15.33 | Col-0 2 | 71754.51999999999 | 227.359062103929 | 142.70000000000002 | 59680.72 | 35 | 24917.4 | 37041.2 | 103.8754224144749 | 11931.099999999999 | 2890 | 5064.45 | 3976.6499999999987 | Col-0 2 | 0.19887248914772204 | 83.17346419431139 | 0.048777414997689346 | 34.72589601324071 | 51.62211384035459 | 16.627663316540893 | 4.027620838380635 | 7.0580222681442235 | 5.5420202100160365 | Ws | 0.2536554662649522 | ± | 0.05355653265583025 | 79.21534714686528 | ± | 0.6420048242744627 | 0.03445720354619943 | ± | 0.006916216453753687 | 27.845114794391446 | ± | 0.6582689932241103 | 55.287673698952375 | ± | 0.5755836605401101 | 20.530997386869757 | ± | 0.6388519927509423 | 2.7089373257498015 | ± | 0.46141917231777185 | 10.09663130794166 | ± | 0.8587341525976818 | 7.725428753178295 | ± | 0.6580109495003585 | 187.0311434726941 | ± | 8.504953696810352 | 0.6459486258134546 | 0.9454792960122854 | 0.04600689857442257 | 1.2292815130884744 | 1.7231085974105698 | 1.534435552054548 | 1.1625119763112792 | 1.2587212175737352 | 0.623644796595388 | 44.99250796500788 | ||||||||||||||
NCS blank | 14 | Col-0 3 | 60349.240000000005 | 295.3952031326481 | 1029.4399999999998 | 51778.5 | -27.200000000000024 | 21763 | 32882.4 | 105.48432264356826 | 7541.3 | 650 | 3306.8000000000006 | 3584.4999999999995 | Col-0 3 | 1.7058044144383586 | 85.79809787165505 | -0.04507099012348792 | 36.06176316387745 | 54.486850207227135 | 12.496097713906588 | 1.077064102215703 | 5.479439343395211 | 5.939594268295672 | lhy/cca1 (fl) | 0.37449445032369405 | ± | 0.0476570285585143 | 90.39347475944122 | ± | 0.7999185055915877 | -0.0644640485532166 | ± | 0.08221556939998122 | 42.27574574274346 | ± | 1.5321959297539127 | 55.66874642094534 | ± | 1.345439531202377 | 9.232030790235092 | ± | 0.8463401810763305 | 0.9244950273178872 | ± | 0.1393066545719478 | 5.30059632860077 | ± | 0.5442363496880182 | 3.006939434316434 | ± | 0.6140001306069902 | 259.6764283147239 | ± | 19.6934717521723 | 0.05355653265583025 | 0.6420048242744627 | 0.006916216453753687 | 0.6582689932241103 | 0.5755836605401101 | 0.6388519927509423 | 0.46141917231777185 | 0.8587341525976818 | 0.6580109495003585 | 8.504953696810352 | ||||||||||||||
acidic | 9.04 | Col-0 4 | 64748.979999999996 | 251.25719829258827 | 121.14000000000001 | 54466.74 | -42.40000000000002 | 23850 | 32521.600000000002 | 103.41944460050298 | 10161.099999999999 | 1900 | 4140.25 | 4120.8499999999985 | Col-0 4 | 0.18709175032564224 | 84.11984250562712 | -0.06548365703984839 | 36.8345570849147 | 50.22720049026256 | 15.69306574404724 | 2.934409159804525 | 6.394309223095098 | 6.364347361147618 | prr7/9 | 0.3899983303242155 | ± | 0.04070830504918652 | 80.2234016014161 | ± | 0.931996207270137 | -0.049914728317449544 | ± | 0.043263813419269194 | 42.36684284922242 | ± | 0.49936209900898565 | 39.84839696862185 | ± | 1.5357704875892044 | 19.386600068259693 | ± | 0.9175596921584043 | 1.76407086626919 | ± | 0.7713042077211923 | 11.4853564462326 | ± | 0.5844917804360515 | 6.137172755757903 | ± | 1.2115580541968216 | 251.1481780493945 | ± | 9.341755122604958 | 0.0476570285585143 | 0.7999185055915877 | 0.08221556939998122 | 1.5321959297539127 | 1.345439531202377 | 0.8463401810763305 | 0.1393066545719478 | 0.5442363496880182 | 0.6140001306069902 | 19.6934717521723 | ||||||||||||||
basic | 9.56 | WS 1 | 48059.079999999994 | 179.79453797231577 | 135.5 | 37651.079999999994 | 13.199999999999967 | 13763.000000000002 | 26491.199999999997 | 106.9488577751289 | 10272.5 | 1070 | 5430.9 | 3771.6000000000004 | WS 1 | 0.281944639805839 | 78.34332242731237 | 0.02746619369326248 | 28.637668469725185 | 55.12215381567853 | 21.37473293288178 | 2.226426306953858 | 11.300466009752997 | 7.847840616174927 | 0.04070830504918652 | 0.931996207270137 | 0.043263813419269194 | 0.49936209900898565 | 1.5357704875892044 | 0.9175596921584043 | 0.7713042077211923 | 0.5844917804360515 | 1.2115580541968216 | 9.341755122604958 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
nucleotide | 12.13 | WS 2 | 80553.07999999999 | 182.3292892711634 | 143.92000000000002 | 63985.259999999995 | 25.799999999999983 | 21770.2 | 44046.6 | 102.90276229244049 | 16423.9 | 2070 | 7536.599999999999 | 6817.300000000002 | WS 2 | 0.1786648008989849 | 79.43241897144095 | 0.03202857047800033 | 27.025906396130356 | 54.680218310708916 | 20.38891622766008 | 2.5697341430023535 | 9.356066831957264 | 8.46311525270046 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1 | A.t. | Col-0 1 | EtOH Soluble | EtOH | 84.15 | 137.64000000000001 | WS 3 | 50140.34 | 198.96960317460315 | 150.6 | 40047.24 | 21.999999999999993 | 13975 | 28109 | 105.14082868132735 | 9942.5 | 1670 | 4830.200000000001 | 3442.2999999999993 | WS 3 | 0.3003569580900329 | 79.87030004184255 | 0.04387684646733547 | 27.87176951731879 | 56.060648970469686 | 19.82934300006741 | 3.3306515272931936 | 9.633361082114721 | 6.865330390659496 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 | Col-0 2 | EtOH Soluble | EtOH | 86.68 | 142.70000000000002 | WS 4 | WS4 (dropped) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3 | Col-0 3 | EtOH Soluble | EtOH | 530.05 | 1029.4399999999998 | L.j. | lhy/cca1 1 | 26879.3 | 278.5419689119171 | 118.62 | 24573.18 | -25.80000000000002 | 10864.8 | 15517.4 | 107.256773441614 | 2187.5 | 230 | 1306.3 | 651.2 | lhy/cca1 1 | 0.4413061352044138 | 91.42046109831729 | -0.09598464245720692 | 40.420695479420964 | 57.72992600253727 | 8.138232766478295 | 0.8556770451611464 | 4.859873583017415 | 2.4226821382997326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | Col-0 4 | EtOH Soluble | EtOH | 75.9 | 121.14000000000001 | lhy/cca1 2 | 26616.660000000003 | 236.59253333333336 | 105.70000000000002 | 24171.06 | -1.8000000000000327 | 10956.000000000002 | 14901.000000000002 | 106.96758851287449 | 2339.9 | 310 | 1262.5500000000002 | 767.3499999999999 | lhy/cca1 2 | 0.3971196987150153 | 90.81176977126356 | -0.006762681718893477 | 41.16218939566422 | 55.98373349623882 | 8.791110530021422 | 1.1646840738094109 | 4.743457668993781 | 2.88296878721823 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | WS 1 | EtOH Soluble | EtOH | 83.08 | 135.5 | lhy/cca1 3 | 21056.3 | 243.7071759259259 | 67.88000000000001 | 18801.82 | -38.60000000000003 | 9296.2 | 11432.2 | 110.04147470829952 | 2186.6 | 180 | 1157.6000000000001 | 848.9999999999998 | lhy/cca1 3 | 0.32237382636075673 | 89.2930856798203 | -0.18331805682859778 | 44.14925699196915 | 54.29348935947912 | 10.384540493818951 | 0.8548510422058956 | 5.49764203587525 | 4.032047415737807 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
6 | WS 2 | EtOH Soluble | EtOH | 87.29 | 143.92000000000002 | lhy/cca1 4 | 25523.600000000006 | 279.86403508771934 | 86.06 | 22983.640000000003 | 7.199999999999989 | 11069.8 | 13953.2 | 108.9044207096874 | 2453.8999999999996 | 210 | 1557.3 | 686.5999999999997 | lhy/cca1 4 | 0.33717814101459037 | 90.0485824883637 | 0.02820918679183182 | 43.3708411039195 | 54.66783682552617 | 9.614239370621695 | 0.8227679480950961 | 6.101412026516634 | 2.6900593960099655 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
7 | WS 3 | EtOH Soluble | EtOH | 90.63 | 150.6 | prr7/9 1 | 34218.16 | 244.4154285714286 | 143.54 | 26916.420000000002 | -34.20000000000002 | 14325.4 | 14375.800000000001 | 106.50376238742001 | 7158.200000000001 | 190 | 4170.299999999999 | 2797.9000000000015 | prr7/9 1 | 0.41948485833253446 | 78.66121381161348 | -0.09994692876531062 | 41.86490448346725 | 42.012194694279295 | 20.919301330053983 | 0.5552607153628365 | 12.187388217250719 | 8.176652397440428 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
8 | WS 4 | EtOH Soluble | EtOH | 127.26 | 223.86 | prr7/9 2 | 38888.3 | 263.64949152542374 | 159.32 | 31538.780000000002 | -1.6000000000000014 | 16586.600000000002 | 14977.2 | 100.07425778676284 | 7190.2 | 670 | 4233.25 | 2286.95 | prr7/9 2 | 0.40968620381965776 | 81.10094810007124 | -0.004114348017269979 | 42.65190301453137 | 38.513383202659924 | 18.48936569610911 | 1.7228832322318022 | 10.885664840067577 | 5.880817623809731 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
9 | lhy/cca1 1 | EtOH Soluble | EtOH | 74.64 | 118.62 | prr7/9 3 | 34761.28 | 256.35162241887906 | 142.88 | 27963.4 | -29.800000000000004 | 14568.2 | 13309.400000000001 | 99.58660248753729 | 6655 | 740 | 4150 | 1765 | prr7/9 3 | 0.41103204484990197 | 80.44410332415838 | -0.0857275681447864 | 41.90927376667373 | 38.28800320356443 | 19.144864630991727 | 2.1288053834611387 | 11.9385707315726 | 5.0774885159579854 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
10 | lhy/cca1 2 | EtOH Soluble | EtOH | 68.18 | 105.70000000000002 | prr7/9 4 | 38500.24 | 240.17616968184652 | 123.12 | 31064.82 | -3.8000000000000256 | 16571 | 15623.400000000001 | 103.62397078109579 | 7312.3 | 1020 | 4208 | 2084.3 | prr7/9 4 | 0.31979021429476806 | 80.68734116982128 | -0.009870068342431178 | 43.041290132217355 | 40.580006773983754 | 18.992868615883953 | 2.649334134020983 | 10.929801996039505 | 5.4137324858234654 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 3 | EtOH Soluble | EtOH | 49.27 | 67.88000000000001 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 4 | EtOH Soluble | EtOH | 58.36 | 86.06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 1 | 87.1 | 143.54 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 2 | 94.99 | 159.32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 3 | 86.77 | 142.88 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 4 | 76.89 | 123.12 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 1 | Water Soluble | Water | 22375.04 | 44728.64 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 2 | Water Soluble | Water | 29851.08 | 59680.72 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 3 | Water Soluble | Water | 25899.97 | 51778.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 4 | Water Soluble | Water | 27244.09 | 54466.74 | Two-tailed, two-sample t-test with equal variance | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 1 | Water Soluble | Water | 18836.26 | 37651.079999999994 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 2 | Water Soluble | Water | 32003.35 | 63985.259999999995 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 3 | Water Soluble | Water | 20034.34 | 40047.24 | ttest | EtOH | Water | Neutral | Acid | Basic | Insol | Starch | Protein | Remaining | Assimilation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 4 | Water Soluble | Water | 20359.67 | 40697.899999999994 | Prr7/9 vs Col0 | 0.6151810269907949 | 0.0015448574064050302 | 0.33014592141268195 | 9.25792527660067E-5 | 7.565642537897797E-5 | 0.005318868364509797 | 0.46153825164228 | 0.0013235065995955335 | 0.5430903846148476 | 0.5931088790468318 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 1 | Water Soluble | Water | 12297.31 | 24573.18 | Lhy/cca1 vs WS | 0.044886523160916764 | 1.3670533582610238E-5 | 0.13932525035394902 | 4.946086735724792E-5 | 0.7134396626372725 | 1.557524748602247E-5 | 0.0016255109370621064 | 6.194479313541211E-4 | 4.276757917820235E-4 | 0.00390767901324832 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 2 | Water Soluble | Water | 12096.25 | 24171.06 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 3 | Water Soluble | Water | 9411.63 | 18801.82 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 4 | Water Soluble | Water | 11502.54 | 22983.640000000003 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 1 | Water Soluble | 13468.93 | 26916.420000000002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 2 | Water Soluble | 15780.11 | 31538.780000000002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 3 | Water Soluble | 13992.42 | 27963.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 4 | Water Soluble | 15543.13 | 31064.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 1 | Insoluble | NCS | 814.4 | 8004 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 2 | Insoluble | NCS | 1207.11 | 11931.099999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 3 | Insoluble | NCS | 768.13 | 7541.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 4 | Insoluble | NCS | 1030.11 | 10161.099999999999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 1 | Insoluble | NCS | 1041.25 | 10272.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 2 | Insoluble | NCS | 1656.39 | 16423.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 3 | Insoluble | NCS | 1008.25 | 9942.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 4 | Insoluble | NCS | 926.08 | 9120.800000000001 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 1 | Insoluble | NCS | 232.75 | 2187.5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 2 | Insoluble | NCS | 247.99 | 2339.9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 3 | Insoluble | NCS | 232.66 | 2186.6 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 4 | Insoluble | NCS | 259.39 | 2453.8999999999996 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 1 | Insoluble | 729.82 | 7158.200000000001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 2 | Insoluble | 733.02 | 7190.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 3 | Insoluble | 679.5 | 6655 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 4 | Insoluble | 745.23 | 7312.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 1 | Starch | 82 | 820 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 2 | Starch | 289 | 2890 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 3 | Starch | 65 | 650 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 4 | Starch | 190 | 1900 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 1 | Starch | 107 | 1070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 2 | Starch | 207 | 2070 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 3 | Starch | 167 | 1670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 4 | Starch | 111 | 1110 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 1 | Starch | 23 | 230 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 2 | Starch | 31 | 310 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 3 | Starch | 18 | 180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 4 | Starch | 21 | 210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 1 | Starch | 19 | 190 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 2 | Starch | 67 | 670 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 3 | Starch | 74 | 740 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 4 | Starch | 102 | 1020 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 1 | prot | 942.5099999999999 | 4712.549999999999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 2 | prot | 1012.89 | 5064.45 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 3 | prot | 661.3600000000001 | 3306.8000000000006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 4 | prot | 828.05 | 4140.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 1 | prot | 1086.1799999999998 | 5430.9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 2 | prot | 1507.32 | 7536.599999999999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 3 | prot | 966.0400000000001 | 4830.200000000001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 4 | prot | 977.4799999999999 | 4887.4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 1 | prot | 261.26 | 1306.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 2 | prot | 252.51000000000002 | 1262.5500000000002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 3 | prot | 231.52 | 1157.6000000000001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
lhy/cca1 4 | prot | 311.46 | 1557.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 1 | prot | 834.06 | 4170.299999999999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 2 | prot | 846.6500000000001 | 4233.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 3 | prot | 830 | 4150 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
prr7/9 4 | prot | 841.6 | 4208 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 1 | Neutral | 12.57 | 8.79999999999999 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 2 | Neutral | 13.88 | 35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 3 | Neutral | 10.77 | -27.200000000000024 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Col-0 4 | Neutral | 10.01 | -42.40000000000002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 1 | Neutral | 12.79 | 13.199999999999967 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WS 2 | Neutral | 13.42 | 25.799999999999983 |