2019-12-20T10:31:32Z $\mathrm{cE4}\mathrm{cE4\_m}\mathrm{gm4}\mathrm{m35}\mathrm{p23}\mapsto \frac{\mathrm{p23}\mathrm{cE4\_m}}{\mathrm{gm4}}-\mathrm{m35}\mathrm{cE4}-\mathrm{cE4}^2$ $\mathrm{cC}\mathrm{cE3\_m}\mathrm{cL}\mathrm{f5}\mathrm{gm3}\mathrm{m26}\mathrm{r21}\mapsto \frac{\mathrm{gm3}\times 1}{1+(\mathrm{r21}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2}-\mathrm{m26}\mathrm{cE3\_m}$ $\mathrm{cCOP1d}\mathrm{cCOP1n}\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cE4d}\mathrm{cGn}\mathrm{m10}\mathrm{m22}\mathrm{m29}\mathrm{m30}\mathrm{m9}\mathrm{p25}\mapsto \mathrm{p25}\mathrm{cE3}\mathrm{cE4d}-\mathrm{m22}\mathrm{cE34}(\mathrm{m30}\mathrm{cCOP1d}+\mathrm{m29}\mathrm{cCOP1n}+\mathrm{m9}+\mathrm{m10}\mathrm{cGn})$ $\mathrm{a7}\mathrm{cC}\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cL}\mathrm{cLUX}\mathrm{cLUX\_m}\mathrm{cNOX}\mathrm{cR}\mathrm{cTn}\mathrm{f1}\mathrm{f2}\mathrm{f3}\mathrm{f4}\mathrm{f5}\mathrm{f6}\mathrm{gmlux}\mathrm{m34}\mathrm{r22}\mathrm{r23}\mathrm{r24}\mathrm{r37}\mapsto \frac{\mathrm{gmlux}(1+\mathrm{a7}\mathrm{r37}\mathrm{cR})}{(1+\mathrm{r37}\mathrm{cR})(1+\left(\frac{\mathrm{r22}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r23}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+(\mathrm{r24}\mathrm{cTn})^2)}-\mathrm{m34}\mathrm{cLUX\_m}$ $\mathrm{cLUX}\mathrm{cLUX\_m}\mathrm{gmlux}\mathrm{m39}\mapsto \frac{\mathrm{cLUX\_m}}{\mathrm{gmlux}}-\mathrm{m39}\mathrm{cLUX}$ $\mathrm{cP5c}\mathrm{cP5n}\mathrm{m42}\mathrm{t5}\mathrm{t6}\mapsto \mathrm{t5}\mathrm{cP5c}-\mathrm{t6}\mathrm{cP5n}-\mathrm{m42}\mathrm{cP5n}$ $\mathrm{cL}\mathrm{cL\_m}\mathrm{gml}\mathrm{light}\mathrm{m3}\mathrm{m4}\mapsto \frac{(\mathrm{light}+\mathrm{m4}(1-\mathrm{light}))\mathrm{cL\_m}}{\mathrm{gml}}-\mathrm{m3}\mathrm{cL}$ $\mathrm{cCOP1c}\mathrm{light}\mathrm{m27}\mathrm{n5}\mathrm{p15}\mathrm{p6}\mapsto \mathrm{n5}-\mathrm{p6}\mathrm{cCOP1c}-\mathrm{m27}\mathrm{cCOP1c}(1+\mathrm{p15}\mathrm{light})$ $\mathrm{cC}\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cL}\mathrm{cLUX}\mathrm{cNOX}\mathrm{cP5n}\mathrm{cP7\_m}\mathrm{cTn}\mathrm{f1}\mathrm{f2}\mathrm{f3}\mathrm{f4}\mathrm{f5}\mathrm{f6}\mathrm{gm7}\mathrm{m14}\mathrm{r10}\mathrm{r41}\mathrm{r8}\mathrm{r9}\mapsto \frac{1}{(1+(\mathrm{r8}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+\left(\frac{\mathrm{r9}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r10}\mathrm{cTn})^2)(1+(\mathrm{r41}\mathrm{cP5n})^2)}\mathrm{gm7}-\mathrm{m14}\mathrm{cP7\_m}$ $\mathrm{cCOP1c}\mathrm{cCOP1n}\mathrm{cP}\mathrm{light}\mathrm{m27}\mathrm{n14}\mathrm{n6}\mathrm{p15}\mathrm{p6}\mapsto \mathrm{p6}\mathrm{cCOP1c}-(\mathrm{n14}+\mathrm{n6}\mathrm{light}\mathrm{cP})\mathrm{cCOP1n}-\mathrm{m27}\mathrm{cCOP1n}(1+\mathrm{p15}\mathrm{light})$ $\mathrm{cCOP1d}\mathrm{cCOP1n}\mathrm{cP}\mathrm{light}\mathrm{m31}\mathrm{m33}\mathrm{n14}\mathrm{n6}\mapsto (\mathrm{n14}+\mathrm{n6}\mathrm{light}\mathrm{cP})\mathrm{cCOP1n}-\mathrm{m31}\mathrm{cCOP1d}(1+\mathrm{m33}(1-\mathrm{light}))$ $\mathrm{cP5\_m}\mathrm{cP5c}\mathrm{cP5n}\mathrm{cZTL}\mathrm{gm5}\mathrm{m17}\mathrm{m24}\mathrm{t5}\mathrm{t6}\mapsto \frac{\mathrm{cP5\_m}}{\mathrm{gm5}}-(\mathrm{m17}+\mathrm{m24}\mathrm{cZTL})\mathrm{cP5c}-\mathrm{t5}\mathrm{cP5c}+\mathrm{t6}\mathrm{cP5n}$ $\mathrm{cP7}\mathrm{cP7\_m}\mathrm{gm7}\mathrm{light}\mathrm{m15}\mathrm{m23}\mapsto \frac{\mathrm{cP7\_m}}{\mathrm{gm7}}-(\mathrm{m15}+\mathrm{m23}(1-\mathrm{light}))\mathrm{cP7}$ $\mathrm{a4}\mathrm{cC}\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cL}\mathrm{cLUX}\mathrm{cNOX}\mathrm{cP5\_m}\mathrm{cR}\mathrm{cTn}\mathrm{f1}\mathrm{f2}\mathrm{f3}\mathrm{f4}\mathrm{f5}\mathrm{f6}\mathrm{gm5}\mathrm{m16}\mathrm{r12}\mathrm{r13}\mathrm{r14}\mathrm{r34}\mapsto \frac{1+\mathrm{a4}\mathrm{r34}\mathrm{cR}}{(1+\mathrm{r34}\mathrm{cR})(1+(\mathrm{r12}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+\left(\frac{\mathrm{r13}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r14}\mathrm{cTn})^2)}\mathrm{gm5}-\mathrm{m16}\mathrm{cP5\_m}$ $\mathrm{cP5n}\mathrm{cT\_m}\mathrm{cTc}\mathrm{cTn}\mathrm{cZTL}\mathrm{gmt}\mathrm{m37}\mathrm{m6}\mathrm{m8}\mathrm{t7}\mathrm{t8}\mapsto \frac{\mathrm{cT\_m}}{\mathrm{gmt}}-(\mathrm{m8}+\mathrm{m6}\mathrm{cZTL})\mathrm{cTc}-\mathrm{t7}\mathrm{cTc}+\frac{\mathrm{t8}}{1+\mathrm{m37}\mathrm{cP5n}}\mathrm{cTn}$ $\mathrm{cE3}\mathrm{cE4}\mathrm{cE4d}\mathrm{m36}\mathrm{p25}\mapsto \mathrm{cE4}^2-\mathrm{m36}\mathrm{cE4d}-\mathrm{p25}\mathrm{cE3}\mathrm{cE4d}$ $\mathrm{a3}\mathrm{cC}\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cL}\mathrm{cLUX}\mathrm{cNOX}\mathrm{cP}\mathrm{cP5n}\mathrm{cP9\_m}\mathrm{cR}\mathrm{cTn}\mathrm{f1}\mathrm{f2}\mathrm{f3}\mathrm{f4}\mathrm{f5}\mathrm{f6}\mathrm{gm9}\mathrm{light}\mathrm{m12}\mathrm{q3}\mathrm{r33}\mathrm{r40}\mathrm{r5}\mathrm{r6}\mathrm{r7}\mapsto \mathrm{gm9}(\mathrm{q3}\mathrm{cP}\mathrm{light}+\frac{1+\mathrm{a3}\mathrm{r33}\mathrm{cR}}{(1+\mathrm{r33}\mathrm{cR})(1+(\mathrm{r5}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+\left(\frac{\mathrm{r6}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r7}\mathrm{cTn})^2)(1+(\mathrm{r40}\mathrm{cP5n})^2)})-\mathrm{m12}\mathrm{cP9\_m}$ $\mathrm{cP9}\mathrm{cP9\_m}\mathrm{gm9}\mathrm{m13}\mapsto \frac{\mathrm{cP9\_m}}{\mathrm{gm9}}-\mathrm{m13}\mathrm{cP9}$ $\mathrm{cCOP1d}\mathrm{cCOP1n}\mathrm{cE3}\mathrm{cE3\_m}\mathrm{cE4d}\mathrm{cGn}\mathrm{gm3}\mathrm{m10}\mathrm{m29}\mathrm{m30}\mathrm{m9}\mathrm{p16}\mathrm{p25}\mapsto \frac{\mathrm{p16}\mathrm{cE3\_m}}{\mathrm{gm3}}-\mathrm{p25}\mathrm{cE3}\mathrm{cE4d}-(\mathrm{m30}\mathrm{cCOP1d}+\mathrm{m29}\mathrm{cCOP1n}+\mathrm{m9}+\mathrm{m10}\mathrm{cGn})\mathrm{cE3}$ $\mathrm{cC}\mathrm{cL}\mathrm{cL\_m}\mathrm{cP}\mathrm{cP5n}\mathrm{cP7}\mathrm{cP9}\mathrm{cTn}\mathrm{f5}\mathrm{gml}\mathrm{light}\mathrm{m1}\mathrm{q1}\mathrm{r1}\mathrm{r11}\mathrm{r2}\mathrm{r3}\mathrm{r4}\mapsto \frac{\frac{\mathrm{q1}\mathrm{light}\mathrm{cP}+1}{1+(\mathrm{r1}\mathrm{cP9})^2+(\mathrm{r2}\mathrm{cP7})^2+(\mathrm{r3}\mathrm{cP5n})^2+(\mathrm{r4}\mathrm{cTn})^2}}{1+(\mathrm{r11}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2}\mathrm{gml}-\mathrm{m1}\mathrm{cL\_m}$ $\mathrm{cP5n}\mathrm{cTc}\mathrm{cTn}\mathrm{m37}\mathrm{m38}\mathrm{m43}\mathrm{t7}\mathrm{t8}\mapsto \mathrm{t7}\mathrm{cTc}-\frac{\mathrm{t8}}{1+\mathrm{m37}\mathrm{cP5n}}\mathrm{cTn}-\frac{\mathrm{m43}}{1+\mathrm{m38}\mathrm{cP5n}}\mathrm{cTn}$ $\mathrm{cP}\mathrm{light}\mathrm{m11}\mathrm{p7}\mapsto \mathrm{p7}(1-\mathrm{light})(1-\mathrm{cP})-\mathrm{m11}\mathrm{cP}\mathrm{light}$ $\mathrm{cC}\mathrm{cC\_m}\mathrm{gmc}\mathrm{light}\mathrm{m3}\mathrm{m4}\mapsto \frac{(\mathrm{light}+\mathrm{m4}(1-\mathrm{light}))\mathrm{cC\_m}}{\mathrm{gmc}}-\mathrm{m3}\mathrm{cC}$ $\mathrm{a5}\mathrm{cC}\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cL}\mathrm{cLUX}\mathrm{cNOX}\mathrm{cR}\mathrm{cT\_m}\mathrm{cTn}\mathrm{f1}\mathrm{f2}\mathrm{f3}\mathrm{f4}\mathrm{f5}\mathrm{f6}\mathrm{gmt}\mathrm{m5}\mathrm{r15}\mathrm{r16}\mathrm{r17}\mathrm{r35}\mapsto \frac{\mathrm{gmt}(1+\mathrm{a5}\mathrm{r35}\mathrm{cR})}{(1+\mathrm{r35}\mathrm{cR})(1+(\mathrm{r15}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+\left(\frac{\mathrm{r16}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r17}\mathrm{cTn})^2)}-\mathrm{m5}\mathrm{cT\_m}$ $\mathrm{cC\_m}\mathrm{cP}\mathrm{cP5n}\mathrm{cP7}\mathrm{cP9}\mathrm{cTn}\mathrm{gmc}\mathrm{light}\mathrm{m1}\mathrm{q1}\mathrm{r1}\mathrm{r2}\mathrm{r3}\mathrm{r4}\mapsto \frac{\mathrm{q1}\mathrm{light}\mathrm{cP}+1}{1+(\mathrm{r1}\mathrm{cP9})^2+(\mathrm{r2}\mathrm{cP7})^2+(\mathrm{r3}\mathrm{cP5n})^2+(\mathrm{r4}\mathrm{cTn})^2}\mathrm{gmc}-\mathrm{m1}\mathrm{cC\_m}$ $\mathrm{a6}\mathrm{cC}\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cE4\_m}\mathrm{cL}\mathrm{cLUX}\mathrm{cNOX}\mathrm{cR}\mathrm{cTn}\mathrm{f1}\mathrm{f2}\mathrm{f3}\mathrm{f4}\mathrm{f5}\mathrm{f6}\mathrm{gm4}\mathrm{m7}\mathrm{r18}\mathrm{r19}\mathrm{r20}\mathrm{r36}\mapsto \frac{\mathrm{gm4}(1+\mathrm{a6}\mathrm{r36}\mathrm{cR})}{(1+\mathrm{r36}\mathrm{cR})(1+\left(\frac{\mathrm{r18}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r19}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+(\mathrm{r20}\mathrm{cTn})^2)}-\mathrm{m7}\mathrm{cE4\_m}$ $\mathrm{cC}\mathrm{cL}\mathrm{cNOX\_m}\mathrm{cP7}\mathrm{f5}\mathrm{gmn}\mathrm{m44}\mathrm{r28}\mathrm{r29}\mapsto \frac{\mathrm{gmn}\times 1}{(1+(\mathrm{r28}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+(\mathrm{r29}\mathrm{cP7})^2)}-\mathrm{m44}\mathrm{cNOX\_m}$ $\mathrm{cR}\mathrm{cR\_m}\mathrm{gmr}\mathrm{m47}\mapsto \frac{\mathrm{cR\_m}}{\mathrm{gmr}}-\mathrm{m47}\mathrm{cR}$ $\mathrm{cCOP1d}\mathrm{cCOP1n}\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cGc}\mathrm{cGn}\mathrm{m19}\mathrm{m25}\mathrm{m28}\mathrm{m32}\mathrm{p28}\mathrm{p29}\mathrm{t9}\mapsto \mathrm{p28}\mathrm{cGc}-\frac{\mathrm{p29}}{1+\mathrm{t9}(\mathrm{cE3}+\mathrm{cE34})}\mathrm{cGn}-\mathrm{m19}\mathrm{cGn}-\mathrm{m25}(\mathrm{cE3}+\mathrm{cE34})(1+\mathrm{m28}\mathrm{cCOP1d}+\mathrm{m32}\mathrm{cCOP1n})\mathrm{cGn}$ $\mathrm{cNOX}\mathrm{cNOX\_m}\mathrm{gmn}\mathrm{m45}\mapsto \frac{\mathrm{cNOX\_m}}{\mathrm{gmn}}-\mathrm{m45}\mathrm{cNOX}$ $\mathrm{a8}\mathrm{cC}\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cG\_m}\mathrm{cL}\mathrm{cLUX}\mathrm{cNOX}\mathrm{cR}\mathrm{cTn}\mathrm{f1}\mathrm{f2}\mathrm{f3}\mathrm{f4}\mathrm{f5}\mathrm{f6}\mathrm{gmg}\mathrm{m18}\mathrm{r25}\mathrm{r26}\mathrm{r27}\mathrm{r38}\mapsto \frac{\mathrm{gmg}(1+\mathrm{a8}\mathrm{r38}\mathrm{cR})}{(1+\mathrm{r38}\mathrm{cR})(1+\left(\frac{\mathrm{r25}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f6}\mathrm{cNOX})(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}{1+\mathrm{f3}(\mathrm{cLUX}+\mathrm{f2}\mathrm{cNOX})+\mathrm{f4}(\mathrm{cE34}+\mathrm{f1}\mathrm{cE3})}\right)^2)(1+(\mathrm{r26}(\mathrm{cL}+\mathrm{f5}\mathrm{cC}))^2)(1+(\mathrm{r27}\mathrm{cTn})^2)}-\mathrm{m18}\mathrm{cG\_m}$ $\mathrm{cGc}\mathrm{cZG}\mathrm{cZTL}\mathrm{light}\mathrm{m20}\mathrm{p10}\mathrm{p12}\mathrm{p13}\mathrm{p14}\mapsto \mathrm{p14}-\mathrm{p12}\mathrm{cZTL}\mathrm{cGc}-(\mathrm{p13}(1-\mathrm{light})+\mathrm{p10}\mathrm{light})\mathrm{cZG}-\mathrm{m20}\mathrm{cZTL}$ $\mathrm{cE3}\mathrm{cE34}\mathrm{cG\_m}\mathrm{cGc}\mathrm{cGn}\mathrm{cZG}\mathrm{cZTL}\mathrm{gmg}\mathrm{light}\mathrm{m19}\mathrm{p10}\mathrm{p11}\mathrm{p12}\mathrm{p13}\mathrm{p28}\mathrm{p29}\mathrm{t9}\mapsto \frac{\mathrm{p11}\mathrm{cG\_m}}{\mathrm{gmg}}-\mathrm{p12}\mathrm{cZTL}\mathrm{cGc}-(\mathrm{p13}(1-\mathrm{light})+\mathrm{p10}\mathrm{light})\mathrm{cZG}-\mathrm{p28}\mathrm{cGc}+\frac{\mathrm{p29}}{1+\mathrm{t9}(\mathrm{cE3}+\mathrm{cE34})}\mathrm{cGn}-\mathrm{m19}\mathrm{cGc}$ $\mathrm{cGc}\mathrm{cZG}\mathrm{cZTL}\mathrm{light}\mathrm{m21}\mathrm{p10}\mathrm{p12}\mathrm{p13}\mapsto \mathrm{p12}\mathrm{cZTL}\mathrm{cGc}-(\mathrm{p13}(1-\mathrm{light})+\mathrm{p10}\mathrm{light})\mathrm{cZG}-\mathrm{m21}\mathrm{cZG}$ $\mathrm{cP5n}\mathrm{cP7}\mathrm{cP9}\mathrm{cR\_m}\mathrm{gmr}\mathrm{m46}\mathrm{r30}\mathrm{r31}\mathrm{r32}\mapsto \frac{\mathrm{gmr}\times 1}{1+(\mathrm{r30}\mathrm{cP9})^2+(\mathrm{r31}\mathrm{cP7})^2+(\mathrm{r32}\mathrm{cP5n})^2}-\mathrm{m46}\mathrm{cR\_m}$ $t\mathrm{offset}\mathrm{amplitude}\mathrm{phase}\mathrm{pulseDuration}\mathrm{cyclePeriod}\mathrm{rampDuration}\mapsto \mathrm{offset}+0.5\mathrm{amplitude}(1+\tanh \left(\frac{\mathrm{cyclePeriod}(\frac{t+\mathrm{phase}}{\mathrm{cyclePeriod}}-\lfloor \frac{t+\mathrm{phase}}{\mathrm{cyclePeriod}}\rfloor )}{\mathrm{rampDuration}}\right))-0.5\mathrm{amplitude}(1+\tanh \left(\frac{\mathrm{cyclePeriod}(\frac{t+\mathrm{phase}}{\mathrm{cyclePeriod}}-\lfloor \frac{t+\mathrm{phase}}{\mathrm{cyclePeriod}}\rfloor )-\mathrm{pulseDuration}}{\mathrm{rampDuration}}\right))+0.5\mathrm{amplitude}(1+\tanh \left(\frac{\mathrm{cyclePeriod}(\frac{t+\mathrm{phase}}{\mathrm{cyclePeriod}}-\lfloor \frac{t+\mathrm{phase}}{\mathrm{cyclePeriod}}\rfloor )-\mathrm{cyclePeriod}}{\mathrm{rampDuration}}\right))$ $\mathrm{step1}$ $\mathrm{stepFunction}(t, \mathrm{offsetStep1}, \mathrm{amplitudeStep1}, \mathrm{phaseStep1}, \mathrm{pulseDurationStep1}, \mathrm{cyclePeriodStep1}, \mathrm{rampDurationStep1})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cL\_m\_trscr}(\mathrm{cC}, \mathrm{cL}, \mathrm{cL\_m}, \mathrm{cP}, \mathrm{cP5n}, \mathrm{cP7}, \mathrm{cP9}, \mathrm{cTn}, \mathrm{f5}, \mathrm{gml}, \mathrm{light}, \mathrm{m1}, \mathrm{q1}, \mathrm{r1}, \mathrm{r11}, \mathrm{r2}, \mathrm{r3}, \mathrm{r4})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cL\_trsl}(\mathrm{cL}, \mathrm{cL\_m}, \mathrm{gml}, \mathrm{light}, \mathrm{m3}, \mathrm{m4})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cC\_trans}(\mathrm{cC\_m}, \mathrm{cP}, \mathrm{cP5n}, \mathrm{cP7}, \mathrm{cP9}, \mathrm{cTn}, \mathrm{gmc}, \mathrm{light}, \mathrm{m1}, \mathrm{q1}, \mathrm{r1}, \mathrm{r2}, \mathrm{r3}, \mathrm{r4})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cC\_trsl}(\mathrm{cC}, \mathrm{cC\_m}, \mathrm{gmc}, \mathrm{light}, \mathrm{m3}, \mathrm{m4})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cP\_trsl}(\mathrm{cP}, \mathrm{light}, \mathrm{m11}, \mathrm{p7})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cP9\_trsc}(\mathrm{a3}, \mathrm{cC}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cL}, \mathrm{cLUX}, \mathrm{cNOX}, \mathrm{cP}, \mathrm{cP5n}, \mathrm{cP9\_m}, \mathrm{cR}, \mathrm{cTn}, \mathrm{f1}, \mathrm{f2}, \mathrm{f3}, \mathrm{f4}, \mathrm{f5}, \mathrm{f6}, \mathrm{gm9}, \mathrm{light}, \mathrm{m12}, \mathrm{q3}, \mathrm{r33}, \mathrm{r40}, \mathrm{r5}, \mathrm{r6}, \mathrm{r7})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cP9\_trsl\_1}(\mathrm{cP9}, \mathrm{cP9\_m}, \mathrm{gm9}, \mathrm{m13})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cP7\_m\_trscr\_1}(\mathrm{cC}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cL}, \mathrm{cLUX}, \mathrm{cNOX}, \mathrm{cP5n}, \mathrm{cP7\_m}, \mathrm{cTn}, \mathrm{f1}, \mathrm{f2}, \mathrm{f3}, \mathrm{f4}, \mathrm{f5}, \mathrm{f6}, \mathrm{gm7}, \mathrm{m14}, \mathrm{r10}, \mathrm{r41}, \mathrm{r8}, \mathrm{r9})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cP7\_trsl\_1}(\mathrm{cP7}, \mathrm{cP7\_m}, \mathrm{gm7}, \mathrm{light}, \mathrm{m15}, \mathrm{m23})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cP5\_m\_trscr}(\mathrm{a4}, \mathrm{cC}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cL}, \mathrm{cLUX}, \mathrm{cNOX}, \mathrm{cP5\_m}, \mathrm{cR}, \mathrm{cTn}, \mathrm{f1}, \mathrm{f2}, \mathrm{f3}, \mathrm{f4}, \mathrm{f5}, \mathrm{f6}, \mathrm{gm5}, \mathrm{m16}, \mathrm{r12}, \mathrm{r13}, \mathrm{r14}, \mathrm{r34})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cP5\_trsl}(\mathrm{cP5\_m}, \mathrm{cP5c}, \mathrm{cP5n}, \mathrm{cZTL}, \mathrm{gm5}, \mathrm{m17}, \mathrm{m24}, \mathrm{t5}, \mathrm{t6})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cP5n\_trans}(\mathrm{cP5c}, \mathrm{cP5n}, \mathrm{m42}, \mathrm{t5}, \mathrm{t6})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cT\_m\_trscr}(\mathrm{a5}, \mathrm{cC}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cL}, \mathrm{cLUX}, \mathrm{cNOX}, \mathrm{cR}, \mathrm{cT\_m}, \mathrm{cTn}, \mathrm{f1}, \mathrm{f2}, \mathrm{f3}, \mathrm{f4}, \mathrm{f5}, \mathrm{f6}, \mathrm{gmt}, \mathrm{m5}, \mathrm{r15}, \mathrm{r16}, \mathrm{r17}, \mathrm{r35})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cT\_trans}(\mathrm{cP5n}, \mathrm{cTc}, \mathrm{cTn}, \mathrm{m37}, \mathrm{m38}, \mathrm{m43}, \mathrm{t7}, \mathrm{t8})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cT\_trasl}(\mathrm{cP5n}, \mathrm{cT\_m}, \mathrm{cTc}, \mathrm{cTn}, \mathrm{cZTL}, \mathrm{gmt}, \mathrm{m37}, \mathrm{m6}, \mathrm{m8}, \mathrm{t7}, \mathrm{t8})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cE4\_m\_trscr\_1}(\mathrm{a6}, \mathrm{cC}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cE4\_m}, \mathrm{cL}, \mathrm{cLUX}, \mathrm{cNOX}, \mathrm{cR}, \mathrm{cTn}, \mathrm{f1}, \mathrm{f2}, \mathrm{f3}, \mathrm{f4}, \mathrm{f5}, \mathrm{f6}, \mathrm{gm4}, \mathrm{m7}, \mathrm{r18}, \mathrm{r19}, \mathrm{r20}, \mathrm{r36})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cE4\_m\_trsl}(\mathrm{cE4}, \mathrm{cE4\_m}, \mathrm{gm4}, \mathrm{m35}, \mathrm{p23})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cE4d\_form}(\mathrm{cE3}, \mathrm{cE4}, \mathrm{cE4d}, \mathrm{m36}, \mathrm{p25})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cE3\_m\_trans}(\mathrm{cC}, \mathrm{cE3\_m}, \mathrm{cL}, \mathrm{f5}, \mathrm{gm3}, \mathrm{m26}, \mathrm{r21})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cE3\_trsl\_1}(\mathrm{cCOP1d}, \mathrm{cCOP1n}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE3\_m}, \mathrm{cE4d}, \mathrm{cGn}, \mathrm{gm3}, \mathrm{m10}, \mathrm{m29}, \mathrm{m30}, \mathrm{m9}, \mathrm{p16}, \mathrm{p25})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cE34\_form}(\mathrm{cCOP1d}, \mathrm{cCOP1n}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cE4d}, \mathrm{cGn}, \mathrm{m10}, \mathrm{m22}, \mathrm{m29}, \mathrm{m30}, \mathrm{m9}, \mathrm{p25})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cLUX\_trans}(\mathrm{a7}, \mathrm{cC}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cL}, \mathrm{cLUX}, \mathrm{cLUX\_m}, \mathrm{cNOX}, \mathrm{cR}, \mathrm{cTn}, \mathrm{f1}, \mathrm{f2}, \mathrm{f3}, \mathrm{f4}, \mathrm{f5}, \mathrm{f6}, \mathrm{gmlux}, \mathrm{m34}, \mathrm{r22}, \mathrm{r23}, \mathrm{r24}, \mathrm{r37})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cLUX\_transl}(\mathrm{cLUX}, \mathrm{cLUX\_m}, \mathrm{gmlux}, \mathrm{m39})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cCOP1c\_transl}(\mathrm{cCOP1c}, \mathrm{light}, \mathrm{m27}, \mathrm{n5}, \mathrm{p15}, \mathrm{p6})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cCOP1n\_trans}(\mathrm{cCOP1c}, \mathrm{cCOP1n}, \mathrm{cP}, \mathrm{light}, \mathrm{m27}, \mathrm{n14}, \mathrm{n6}, \mathrm{p15}, \mathrm{p6})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cCOP1d\_trans}(\mathrm{cCOP1d}, \mathrm{cCOP1n}, \mathrm{cP}, \mathrm{light}, \mathrm{m31}, \mathrm{m33}, \mathrm{n14}, \mathrm{n6})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cZTL\_transl}(\mathrm{cGc}, \mathrm{cZG}, \mathrm{cZTL}, \mathrm{light}, \mathrm{m20}, \mathrm{p10}, \mathrm{p12}, \mathrm{p13}, \mathrm{p14})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cZG\_form}(\mathrm{cGc}, \mathrm{cZG}, \mathrm{cZTL}, \mathrm{light}, \mathrm{m21}, \mathrm{p10}, \mathrm{p12}, \mathrm{p13})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cG\_trans}(\mathrm{a8}, \mathrm{cC}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cG\_m}, \mathrm{cL}, \mathrm{cLUX}, \mathrm{cNOX}, \mathrm{cR}, \mathrm{cTn}, \mathrm{f1}, \mathrm{f2}, \mathrm{f3}, \mathrm{f4}, \mathrm{f5}, \mathrm{f6}, \mathrm{gmg}, \mathrm{m18}, \mathrm{r25}, \mathrm{r26}, \mathrm{r27}, \mathrm{r38})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cGc\_transl}(\mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cG\_m}, \mathrm{cGc}, \mathrm{cGn}, \mathrm{cZG}, \mathrm{cZTL}, \mathrm{gmg}, \mathrm{light}, \mathrm{m19}, \mathrm{p10}, \mathrm{p11}, \mathrm{p12}, \mathrm{p13}, \mathrm{p28}, \mathrm{p29}, \mathrm{t9})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cGn\_transp}(\mathrm{cCOP1d}, \mathrm{cCOP1n}, \mathrm{cE3}, \mathrm{cE34}, \mathrm{cGc}, \mathrm{cGn}, \mathrm{m19}, \mathrm{m25}, \mathrm{m28}, \mathrm{m32}, \mathrm{p28}, \mathrm{p29}, \mathrm{t9})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cNOX\_m\_trans}(\mathrm{cC}, \mathrm{cL}, \mathrm{cNOX\_m}, \mathrm{cP7}, \mathrm{f5}, \mathrm{gmn}, \mathrm{m44}, \mathrm{r28}, \mathrm{r29})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cNOX\_transl}(\mathrm{cNOX}, \mathrm{cNOX\_m}, \mathrm{gmn}, \mathrm{m45})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cR\_m\_trans}(\mathrm{cP5n}, \mathrm{cP7}, \mathrm{cP9}, \mathrm{cR\_m}, \mathrm{gmr}, \mathrm{m46}, \mathrm{r30}, \mathrm{r31}, \mathrm{r32})$ $\mathrm{compartment\_}\mathrm{function\_4\_cR\_transl}(\mathrm{cR}, \mathrm{cR\_m}, \mathrm{gmr}, \mathrm{m47})$ $t> 314$ $0$ $1$ $1$